Mercator s'est doté d'un système complémentaire au modèle de prévision numérique décrivant également l'océan en temps réel et dans ses trois dimensions. Celui-ci s'appuie uniquement sur les données d'observations de l'océan : satellitaires (altimétrie, températures de surface de la mer) et in situ (profils immergés et bouées dérivantes). Il ne fait pas de prévision.